Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRABDQ9H4I3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRABDQ9H4I3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms