Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NXF3Q9H4D5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NXF3Q9H4D5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms