Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDCL3Q9H2J4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDCL3Q9H2J4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms