Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRTNQ9H040 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPRTNQ9H040 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPRTNQ9H040 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SPRTNQ9H040 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms