Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GFRA4Q9GZZ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA4Q9GZZ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms