Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCDC90BQ9GZT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC90BQ9GZT6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 295.7 ms