Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
REXO4Q9GZR2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
REXO4Q9GZR2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms