Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PDGFDQ9GZP0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PDGFDQ9GZP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PDGFDQ9GZP0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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