Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CNTNAP4Q9C0A0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CNTNAP4Q9C0A0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms