Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NMES1Q9C002 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NMES1Q9C002 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms