Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDHR2Q9BYE9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CDHR2Q9BYE9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDHR2Q9BYE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms