Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PCGF6Q9BYE7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
PCGF6Q9BYE7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms