Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL4Q9BYD3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL4Q9BYD3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms