Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABARAPL3Q9BY60 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABARAPL3Q9BY60 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABARAPL3Q9BY60 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms