Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAIPQ9BWF2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAIPQ9BWF2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms