Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC94Q9BW85 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC94Q9BW85 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC94Q9BW85 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms