Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIOK2Q9BVS4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIOK2Q9BVS4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms