Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBB2BQ9BVA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBB2BQ9BVA1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms