Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLR3CQ9BUI4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR3CQ9BUI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms