Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBB6Q9BUF5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TUBB6Q9BUF5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TUBB6Q9BUF5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms