Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFJQ9BTM1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
H2AFJQ9BTM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms