Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
C2orf88Q9BSF0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms