Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RIOK1Q9BRS2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RIOK1Q9BRS2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
RIOK1Q9BRS2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RIOK1Q9BRS2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms