Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPIN3Q9BQK8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LPIN3Q9BQK8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPIN3Q9BQK8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms