Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPIN2AQ99865 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIN2AQ99865 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms