Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARID3AQ99856 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms