Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD5Q99666 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD5Q99666 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RGPD5Q99666 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms