Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EIF3CQ99613 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EIF3CQ99613 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms