Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT12Q99456 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KRT12Q99456 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms