Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TCF12Q99081 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TCF12Q99081 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TCF12Q99081 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms