Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMS19Q96T76 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MMS19Q96T76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms