Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRAMP1Q96RY5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CRAMP1Q96RY5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms