Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGLYRP2Q96PD5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGLYRP2Q96PD5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms