Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC115Q96NT0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC115Q96NT0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC115Q96NT0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms