Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU8

KREMEN1, Kremen protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KREMEN1Q96MU8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
KREMEN1Q96MU8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KREMEN1Q96MU8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms