Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT3

PRICKLE1, Prickle-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE1Q96MT3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE1Q96MT3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE1Q96MT3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRICKLE1Q96MT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRICKLE1Q96MT3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRICKLE1Q96MT3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms