Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ZNF488Q96MN9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ZNF488Q96MN9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms