Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCMTD1Q96MG8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCMTD1Q96MG8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCMTD1Q96MG8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms