Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC7Q96M83 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CCDC7Q96M83 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms