Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKNOX2Q96KN3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKNOX2Q96KN3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKNOX2Q96KN3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms