Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG8

MAGED4, Melanoma-associated antigen D4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED4Q96JG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MAGED4Q96JG8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MAGED4Q96JG8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms