Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCTD12Q96CX2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCTD12Q96CX2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms