Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KLHL29Q96CT2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL29Q96CT2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms