Protein–RNA interactions for Protein: Q96B02

UBE2W, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2WQ96B02 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UBE2WQ96B02 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2WQ96B02 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2WQ96B02 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2WQ96B02 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2WQ96B02 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2WQ96B02 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UBE2WQ96B02 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms