Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX21Q969T3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX21Q969T3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms