Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HDAC10Q969S8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDAC10Q969S8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms