Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP2A3Q93084 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP2A3Q93084 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms