Protein–RNA interactions for Protein: Q93073

SECISBP2L, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2LQ93073 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SECISBP2LQ93073 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SECISBP2LQ93073 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SECISBP2LQ93073 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms