Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EXT2Q93063 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EXT2Q93063 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms