Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
USP7Q93009 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
USP7Q93009 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
USP7Q93009 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
USP7Q93009 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
USP7Q93009 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP7Q93009 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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